Herramientas morfométricas para el análisis de datos acústicos

La Bioacústica es el estudio del comportamiento de comunicación de los animales a través de señales sonoras. Esta disciplina, que combina la biología y la acústica, se ha convertido en una herramienta indispensable en estudios de biodiversidad y conservación.

Por otro lado, la morfometría geométrica es una herramienta que nos permiten analizar independientemente la conformación y el tamaño de una estructura, mediante el uso de descriptores matemáticos. Recientemente se han desarrollado estrategias para aplicar estas herramientas al análisis de la varianza de los datos acústicos, permitiendo evaluar, mediante análisis estadísticos, las diferencias en las unidades de construcción de llamados o cantos, en diferentes grupos taxonómicos.

Rejilla de muestreo de un pulso de ecolocalización sobre el espectrograma tridimensional.

Presentación: Este curso esta dirigido a estudiantes de posgrado, profesores e investigadores interesados en aplicar los protocolos de morfometría geométrica en el estudio de la señal acústica.

El curso contiene tanto elementos teóricos como prácticos para analizar datos acústicos descritos mediante coordenadas, visualizar rejillas de deformación e interpretar resultados. Se brindará instrucción práctica en la serie de programas especializados de bioacústica: Raven, Kaleidoscope y BatScope; y en los programas de

morfometría geométrica para R: geomorph, Shapes, Morpho, ShapeSound, Bioacoustics y captura de coordenadas en TpsDig2.

Objetivos: Dar instrucción teórica y práctica en los métodos para la obtención y visualización de datos acústicos, así como en el registro de datos morfométricos (coordenadas de marcas), la ordenación y el análisis estadístico de la variación en la forma de los elementos de construcción de datos acústicos

Requisitos: Equipo de computo, tener instaladas la versión R 4.0 o posteriores, y las librerías geomorph, RRPP, Shapes, Morpho, Bioacoustics y ShapeSound, así como el paquete para gráficos ggplot2. Además, deberán tener conocimientos básicos de en R, y estar desarrollando proyectos de investigación sobre variación en la señal acústica de diferentes grupos taxonómicos. Llenar encuesta de aplicación y enviarla junto con la solicitud de participación al correo de contacto.

Intensidad: Intensivo (40 horas: 8 horas/día).

Modalidad presencial

Fecha: 23 al 27 de enero de 2023.

Costo: Gratuito

Cupo máximo: 22 participantes. Se publicará la lista de aceptados el 10 de diciembre de 2022.

Lugar: Centro de Investigaciones Tropicales, Xalapa, Ver.

Contacto: ospinagarcess@gmail.com, cmacswiney@uv.mx

PROGRAMA DETALLADO

Organiza: Posgrado Centro de Investigaciones Tropicales (CITRO), Universidad Veracruzana, Xalapa,Ver.

Programa del curso

Introducción a la Bioacústica

Teoría y generalidades de la bioacústica.

Implicaciones ecológicas de la señal acústica. La comunicación acústica en diferentes grupos taxonómicos.

Práctica 1: Visualización y edición de datos acústicos. Herramientas gráficas de visualización de datos.

Sistemas de detección acústica

Aplicaciones de la bioacústica en el estudio de la biodiversidad.

Sistemas de detección acústica y variaciones en la señal acústica.

Revisión de Bibliotecas acústicas (Sonozots, Chirovox, Xeno-canto).

Práctica 2: Toma de datos acústicos de murciélagos (Echometer) y otros grupos de vertebrados e insectos (AudioMoth).

Práctica 3: Análisis de grabaciones y parámetros acústicos.

Análisis morfométricos

Introducción a la Morfometría Geométrica. Protocolo morfométrico.

Registro. Marcas: criterios y tipología. Semimarcas: definición de contornos. Matrices de configuración.

Teoría de la forma. Vectores y espacios. Métodos de superposición. Análisis de contornos.

Práctica 4: Software para registro de marcas y semimarcas en 2d, tpsUtils, tpsDig. Edición de unidades acústicas comparables y muestreo de semimarcas en R. Software: geomorph, ShapeSound.

Métodos de ordenación y análisis estadísticos

Varianza morfológica de datos acústicos y Métodos de ordenación (PCA y CVA).

Comparación de unidades acústicas y rejillas de deformación. Regresión forma de las unidades acústicas y variables ecológicas.

Práctica 5: Alineamiento y construcción del morfoespacio de las unidades acústicas (PCA), comparaciones entre grupos (CVA), rejillas de deformación. Software: Biocoustics, ShapeSound, MASS y geomorph

Aplicaciones en Ecología

Disparidad morfológica y paisajes acústicos. Variación intraespecífica dela señal acústica. Deformación de la señal acústica.

Práctica 6: Regresión datos acústicos y variables ambientales. Disparidad morfológica y comparaciones entre grupos. Software: ShapeSound y geomorph.

Muestreo de semimarcas sobre datos de entrenamiento (cantos de ranas) , del paquete de R ShapeSound.

Primera versión del curso realizado en la Universidad Pedagógica y Tecnológica de Colombia, Tunja-Boyacá, 2021.